玛曲县位于甘南藏族自治州西南部，西与青海省久治、甘德、玛沁县接壤，东南与四川省若尔盖、阿坝县隔黄河相望，西北紧连青海省河南蒙古族自治县， 东北与本州碌曲县为邻。东径100°46′至102°29′北纬33°06′至34°33′。地势西高东低，由西北向东南倾斜，海拔在3300至4806米之间。气候属高寒湿润型。长冬无夏，气候严寒是其特征。年均气温1．1℃，年降水量615．5毫米，年相对无霜期仅19天。全县总面积10109．67平方公里，其中天然草地1365．90万亩，占总面积的89．4％，共辖8个乡，总人口3．71万多人，其中藏族人口占88％。
　　玛曲县草原辽阔，河流纵横，天然植被优良，种类繁多，约57科、204属、430余种，以适应高寒湿润气候的草木檀被和灌木为主。是“河曲马”、“欧拉羊”的产地，也是全国黄金生产大县之一，此外，还有煤、银、铅、钨、铜、泥碳等矿产资潭，有待于开发利用。黄河自青海省久治县流人玛曲，从东、南、北三面环绕县境，淀程约433公里，因受西倾山的阻挡，在这里形成了180度的弯曲部，称之为“黄河首曲”。境内生患的珍贵动物有马鹿、雪豹、麝、梅花鹿、白唇鹿、棕熊、猞猁、水獭等。野药材极其丰富，价值很高的有烈香杜鹃、青海杜鹃、列叶羌活、海母雪莲、贝母、黄芪、冬虫夏草等。
　　玛曲县交通便利，主要公路有尕(海)玛(曲)线及两(河口)阿(万仓)线。境内黄河上架有齐哈玛钢索公路桥及县城附近双曲拱水泥大桥，沟通了玛曲与外界的联系。